实验结果: 分别采用金斯瑞设计平台和其他设计软件设计siRNA序列,通过qPCR检测对应mRNA水平,实验验证结果表明,金斯瑞设计的siRNA的基因沉默效率 ( knockdown efficiency, KD% )更高,活性更好。
各套餐可选筛选条数为20、50、100、200条序列。
* 简单修饰的ASO:添加Gapmer类型 (PS, MOE, OMe)的修饰,所有序列均采用固定的修饰方案。 复杂修饰的ASO:其他定制化的修饰。
| 服务名称 | 服务内容 | 基础套餐 | 精选套餐 | 高级套餐 |
|---|---|---|---|---|
| 设计 | 裸 siRNA序列 / 简单修饰 ASO | |||
| 修饰 siRNA序列 / 复杂修饰 ASO | ||||
| 合成 | RNase free HPLC, 5nmol | |||
| 体外筛选 (mRNA水平) |
预实验:确认目标基因筛选检测方案 | |||
| 第一轮 序列筛选:对裸 siRNA / 简单修饰 ASO序列筛选,单浓度检测mRNA水平敲降效率 | ||||
| 第二轮 序列 IC50 筛选: 筛选10条候选序列进行 IC₅₀ 检测 | ||||
| 第三、四轮 修饰筛选:对修饰 siRNA / 复杂修饰 ASO序列做单浓度筛选,并选择5条候选序列进行 IC₅₀ 检测 | ||||
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| 生物分析检测 |
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| 体内 PK/PD |
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| 交付物 |
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| 附件服务 | 服务内容 |
|---|---|
| 专利检索 | 查询候选序列是否有被已授权专利覆盖,提供候选序列的风险等级供客户评估和选择进一步开发的序列 |
订购方式:请下载金斯瑞小核酸药筛选服务询价单,填写您的需求后,发送给您的技术支持或者oligo@genscript.com.cn。
实验结果: 分别采用金斯瑞设计平台和其他设计软件设计siRNA序列,通过qPCR检测对应mRNA水平,实验验证结果表明,金斯瑞设计的siRNA的基因沉默效率 ( knockdown efficiency, KD% )更高,活性更好。
基于金斯瑞优化的AI设计能力和稳定的筛选平台,设计的50组siRNA中:
针对B基因,50条siRNA在人前列腺癌细胞系中mRNA水平的敲降效率。用RNAiMAX在人前列腺癌细胞系中转染50条siRNA,转染浓度为1nM,转染48h后提取细胞RNA、反转录,qPCR检测mRNA水平的敲降效率。
基于金斯瑞优化的AI设计能力和稳定的筛选平台,设计的150组ASO中:
针对X基因,150条ASO在Hep3B细胞系中mRNA水平的敲降效率。用RNAiMAX在Hep3B细胞系中转染150条ASO,转染浓度为30nM,转染48h后提取细胞RNA、反转录,qPCR检测mRNA水平的敲降效率。
ELISA
应用:分泌蛋白的定量
优势:支持定性和定量,可使用酶标仪检测
用ELISA的方法检测X基因15条siRNA在HepG2细胞系中蛋白水平的敲降效率。用RNAiMAX在HepG2细胞系中转染15条siRNA,转染浓度为10nM,转染48h后收集细胞上清液,用ELISA试剂盒检测目的基因蛋白水平的敲降效率。
免疫荧光染色
应用:膜蛋白的定量
优势:支持定性和定量,可使用流式细胞仪检测
在H1975细胞系中用免疫荧光染色的方法检测X基因5条siRNA在不同浓度条件下蛋白水平的敲降效率。用RNAiMAX在H1975细胞系中转染5条siRNA,转染浓度分别为10nM、1nM、0.1nM,转染48h后用对应抗体染色,然后用流式检测目的基因蛋白水平的敲降效率。
Western blot
应用:多种蛋白的定量
优势:支持定性和半定量,可使用凝胶电泳检测
在人前列腺癌细胞系中用WB的方法检测A基因和B基因siRNA在不同浓度条件下蛋白水平的敲降效率。用RNAiMAX在人前列腺癌细胞系中转染A基因和B基因的siRNA,转染浓度分别为10nM、1nM、0.1nM,转染72h后用RIPA裂解液裂解细胞,获取蛋白,然后用WB的方法检测目的基因蛋白水平的敲降效率。