全质粒测序服务

服务内容

Next-Generation Sequencing (NGS)

订购讯息

质粒长度 (bp)	价格	交付周期（工作日）
≤ 5kb	¥58	3
5-20kb	¥108
20-35kb	¥168
> 35kb	联系我们

交付内容

• excel 报告: 包含测序数据量、质控结果、比对结果、变异结果
• pdf 报告：将excel中的关键结果、具体的变异位点以及质粒测序深度模式图整合生成该报告
• gbk 文件：由 pLannotate注释生成包含质粒中每个原件的GenBank 文件

* 联系我们索取样本报告

Oxford Nanopore Technologies (ONT)

订购讯息

质粒长度 (bp)	价格	交付周期（工作日）
2.5-25kb	¥140	2
25-125kb	¥280
125-300kb	¥560

交付内容

• Nanopore_result.pdf: 原始数据的质量控制结果，参考序列的比对结果，和变异检测结果
• Nanopore_result.xlsx: 原始数据的质量控制结果、变异检测结果、每个位点的测序深度，和检测到的碱基类型的统计数据
• vars_pLann.gbk: 质粒功能元素（由pLannotate注释）、变异检测结果（包括结构变异）和参考序列组成
• pLann.html: 质粒示意图
• .final.fa : 重建的DNA序列用突变碱基替代参考序列中的碱基，只有具有高置信度且突变频率大于60%的突变才用于替代
• NanoPlot-report.html: 由NanoPlot生成的原始数据的质量控制结果
• .fastq file: raw data: 联系我们索取

* 联系我们索取样本报告

常见问题解答 (FAQ)

• 1. 收样标准？

  NGS收样标准

  质粒长度 (bp)	浓度	容量
  ≤ 5kb	10 ng/μL	≥20 μL
  5-20kb
  20-35kb

  溶剂：	Nuclease-free Water 或 Elution buffer（溶剂中不能含有EDTA）
  浓度：	浓度必须采用Qubit，不能使用Nanodrop进行检测
  纯度：	建议 260/280=1.7 – 2.0； 260/230=2.0-2.2，送测样本必须是单克隆质粒，若是混合物，可能会造成结果不准确
  完整度：	建议采用琼脂糖凝胶电泳对质粒进行检测，判断是否存在降解情况，质粒降解可能会造成测序失败
  寄送方式：	干冰

  Nanopore收样标准

  质粒长度 (bp)	浓度	容量
  ＜20 kb	30 ng/μL	≥10 μL
  20-100 kb	50 ng/μL	≥20 μL
  100-300 kb	50 ng/μL	≥40 μL

  溶剂：	Nuclease-free Water 或 Elution buffer（溶剂中不能含有EDTA）
  浓度：	浓度必须采用Qubit，不能使用Nanodrop进行检测
  纯度：	建议 260/280=1.7 – 2.0； 260/230=2.0-2.2，送测样本必须是单克隆质粒，若是混合物，可能会造成结果不准确
  完整度：	建议采用琼脂糖凝胶电泳对质粒进行检测，判断是否存在降解情况，质粒降解可能会造成测序失败
  寄送方式：	干冰

• 2. 如何订购全质粒测序服务？

  您可以将全质粒测序服务与您的基因合成和质粒制备项目捆绑，或者将样本寄给我们。

• 3. 你是如何对样本进行测序的？

  在金斯瑞，我们采用先进的测序技术和方法对您的质粒样本进行测序。我们拥有全面的测序平台（Sanger测序，NGS，Nanopore），可以为您的质粒提供完整准确的序列分析，无论您是否处理大质粒或难以测序的区域，如ITR和GC-rich区域。

• 4. 为什么需要对质粒全长进行测序?
  1. 验证序列完整性：质粒在克隆或扩增过程中可能会发生遗传修饰，导致潜在的序列错误或不希望的突变。
  2. 克隆和工程的质量控制：测序质粒作为质量控制步骤，用于验证克隆插入物的准确性，确认不存在不需要的突变，并确保实验系统的完整性。
  3. 优化实验设计：准确了解质粒序列使您能够更有效地设计实验。
• 5. 测序结果的准确性如何?

  目前的碱基准确性大于95%，并且可通过一致性序列进行矫正，矫正后的准确率可达99.9%。

• 6. 测序失败的原因有哪些?

  所有序列未达到30xcoverage即说明测序失败，造成建库失败的主要原因有：未按照要求用Qubit检测浓度，存在基因组和质粒的片段，其它质粒杂质，存在质粒降解的现象，所以建议客户送样前确定样本是否达标。

• 7. 您能否修复全质粒测序中检测到的突变？

  是的，通过使用GenScript的定点突变服务，您可以受益于我们的专业知识和简化流程，旨在提供快速的交付时间、节省成本，并在引入或修复突变时保持高准确性。