一个单链可变区由重链可变区(VH)及轻链(VL)可变区构成，两者通过15-20个氨基酸链接。ScFvs的每个亚基包括3个可与抗原结合的超高互补决定区(CDRs)。由于ScFvs仅有约25kDa, 因此ScFvs被认为是含有全抗原结合活性的较小IgG单元。

与传统全长单抗或其他类型的抗体片段相比，ScFvs的明显优势使得它在科研界受到广泛关注。优势包括：

• 分子量小
• 组织穿透力强
• 快速血液清除
• 免疫原性降低
• 特异性高

• 细胞内抗体

细胞内抗体是一种以单链抗体形式再细胞内表达并且定位于亚细胞区室如细胞核、细胞质或某些细胞器中，通过靶向作用目标蛋白而发挥抑制功能。

• 构建单链抗体融合蛋白

通过DNA重组技术将单链抗体基因与其他效应蛋白基因融合在一起，经表达后可以得到具有单链抗体和所融合效应蛋白活性的单链抗体融合蛋白。应用包括：

• 单链抗体携带大剂量放射性核素在疾病的显像过程中发挥作用，用于临床诊断。
• 肿瘤相关单链抗体与毒性蛋白或细胞因子融合形成的重组毒素或免疫毒素可将细胞杀伤效应引导到肿瘤部位。
• 共价链接PEG或连接在天然存在的半衰期较长的血清蛋白或啊抗体恒定区片段都可以延长单链抗体的半衰期。