3730测序仪简介
3730测序仪技术特点:
Applied Biosystems推出的3730系列,代表了进行高通量、高质量测序和片段分析的新一代平台,3730整合了自动化装置和光学技术的最新进展,同样应用Applied Biosystems优化的试剂和专门的软件系统,可以完全满足实验者日益增加的通量需求和质量需求,为您提供全面的测序服务。
3730DNA分析系统的技术特点:
- 双光束双侧激光激发,后置超薄CCD
- 全自动上样系统
- 内置条形码阅读器
- 自动碱基识别与质量评分软件
- 最新推出POP-7液体分离胶
- 良好的温控装置提供了更大的温控范围(18~70℃)
3730DNA分析系统用于DNA测序的主要优点:
- 电泳温度可达70℃,有助于去除二级结构的影响
- 良好温控装置保证片段分析准确性及重现性好
- 新的液体分离胶(POP~7TM Polymer)使通常读序长度即可达800bp
- 新型碱基识别与质量评分软件,提高测序准确性
- 毛细管内荧光检测,灵敏度高
- 双光束双侧激光激发,荧光信号强度高度均一
- 高灵敏度提高了测序模板DNA的浓度范围
如果您提供纯化好的PCR产物,条带必须单一,纯度OD260/OD280=1.6~2.0。最好溶解在灭过菌的去离子水中,浓度要求>50 ng/μl,提供10μl以上。同时请您提供PCR引物,并注明浓度,一定要提供经PAGE纯化的引物,浓度大于5pmol/μl。
注意事项:
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PCR产物直接测序成功的关键是PCR产物的纯度,所以我们提倡切胶回收PCR产物。如果有几条PCR产物长度相近,用电泳胶也无法分开,此时的PCR产物便无法直接测序。这种情况建议把PCR产物克隆后测序。
- PCR产物直接测序成功的另一要因是引物,不能做PCR反应的引物便能测序。测序用引物要求较高,引物的3’端必须与模板完全其配,含有Mix碱基的引物一般不能测序(特别是3’端)。此外,测序引物长度一般为20个碱基左右,GC含量必须在50~60%左右。而且用于测序的引物一定要经过PAGE纯化,纯度必须大于90%。
- 在PCR扩增时,难以扩增(扩增后的PCR带较弱)的PCR产物在测序时一般成功率较低。
- 小于150bp的PCR产物直接测序效果不好,建议克隆后测序。
注:以下电泳图片均为2微升上样量。
- PCR未纯化产物,如下图:
- PCR纯化产物,如下图:
- 质粒,如下图:
Cosmid中插入DNA片段的测序:
请提供纯化后的Cosmid DNA大于5μg(因每个反应的用量需1μg以上)。DNA必须注明浓度,并请提供浓度(浓度必须正确)大于5pmol/μl的引物10μl以上。
其它说明:
客户在提供测序样品的同时,请注明用何种引物,测几个反应,是否测通,是单链测序还是双链测序等。
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