分子生物学
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OptimumGeneTM 密码子优化

作为全球最大的基因合成供应商之一，金斯瑞自主研发了新技术OptimumGeneTM 并将它运用到基因表达系统中。金斯瑞OptimumGeneTM密码子优化是一项基因优化技术，可以在任何表达系统中重组基因序列，以达到最高的表达水平。OptimumGeneTM 运算法则充分考虑到蛋白表达不同阶段可能遇到的多种复杂因素，如：密码子适应性、mRNA结构以及转录和翻译过程中不同的顺式元件。


  • 优势
  • 优化参数
  • Track Record
  • 实验案例
    蛋白表达水平提高至少十倍

有效优化复杂序列：
OptimumGeneTM 精湛的算法可以优化高度重复序列，长序列，含大量参数的序列，软件投入应用不久，我们就已经成功优化了超过30个复杂序列。
全面的密码子使用频率表适用于任何寄主：
金斯瑞拥有非常完整的密码子使用频率表，客户可用于任何寄主，可用于进行基础研究或是满足工业需求。我们还拥有极其可靠的生物体密码子表，如被广泛用于研发进程的Pichia和Sf9。
专业设计DNA疫苗：
金斯瑞提供有效的措施满足客户基因疫苗需求，通过OptimumGeneTM 技术，筛选以及优化参数，调节疫苗基因表达和免疫原性。
量身打造设计方案：
针对不同客户的需求，OptimumGeneTM 基因设计系统量身打造设计方案，提供最适合客户的优化条件。
相关资源：
  使用Genscript Rare Codon Analysis Tool，检测您的基因是否需要优化。
OptimumGeneTM 运算法则主要对转录、翻译和蛋白折叠等多种相关参数进行优化设计。

转录效率：
   ● GC含量    ● SD序列
   ● CpG二核苷酸含量    ● TATA框
   ● 隐蔽剪接位点    ● 终止信号
   ● 阴性CpG岛
翻译效率：
   ● 密码子偏爱性    ● 抑制位点
   ● GC含量    ● RNA不稳定性基序
   ● mRNA二级结构    ●  mRNA自由能稳定性
   ● PolyA早期信号    ● 潜在的Chi序列和核糖体结合位点
蛋白折叠：
   ● 密码子偏爱性    ● 密码子上下文关联
   ●  RNA二级结构    ● 密码子与反密码子交互作用
序列挑选：
  针对每一个序列，OptimumGeneTM 均提供超过10000条序列备选，再通过复杂的挑选矩阵选出最符合客户需求的优化序列。

OptimumGeneTM History of Successful Codon Optimization

GenScript has accumulated years of experience in codon optimization and gene synthesis. Our codon optimization system has optimized over 50,000 sequences in almost all major expression systems. Many top pharmaceutical companies are our customers.

Customer Testimonial

"I think GenScript provides absolutely excellent products in a timely fashion. I have primarily used genscript to order codon optimized artificial genes. Ordering artificial genes on their website or via Email makes this especially facile because I can simply inquire about a gene, get a quote and then get a PO#. The whole process is fast and the turnaround time for obtaining the finished product is usually less than a month. I also think their technical support are wonderful people, they have been most helpful in facilitating the process. I am so impressed with them that I have recommended them to several of my colleagues."

― Dr. Maria Schumacher, The University of Texas. M.D. Anderson Cancer Center

Publications

Ning Shao and Ralph Bock. A codon-optimized luciferase from Gaussia princeps facilitates the in vivo monitoring of gene expression in the model alga Chlamydomonas reinhardtii. Curr Genet. Jun 2008
Burgess-Brown NA, Sharma S, Sobott F, Loenarz C, Oppermann U, Gileadi O. 6. Codon optimization can improve expression of human genes in Escherichia coli: A multi-gene study. Protein Expr Purif. May 2008; 59(1): 94-102
V. Melkebeek, E. Sonck, F. Verdonck, B. M. Goddeeris, and E. Cox. Optimized FaeG Expression and a Thermolabile Enterotoxin DNA Adjuvant Enhance Priming of an Intestinal Immune Response by an FaeG DNA Vaccine in Pigs. Clinical and Vaccine Immunology. Jan 2007; 14(1): 28-35

下图为OptimumGeneTM技术优化效果展示，两条基因E. coli蛋白表达水平经优化后迅速上升。



Fig. A. 金斯瑞OptimumGeneTM 密码子优化技术，使得优化后的protein α 表达水平相比未优化的序列提高了10倍。与国际知名的竞争对手GA相比，提高了3倍多。



Fig. B. 金斯瑞OptimumGeneTM 密码子优化技术，使得优化后的protein β 表达水平相比未优化的序列提高了20倍。与国际知名的竞争对手GA相比，提高了13倍多。

注：金斯瑞承诺，不会以知识产权或技术协议等形式，索取OptimumGeneTM 密码子优化与基因合成服务方面的任何权利，如基因序列或客户提交的任何资料等等。未经客户同意，金斯瑞也不会发布任何第三方的信息，敏感性信息仅会让项目具体负责人知晓。如果客户需要，我们可以签署保密协议，确保客户优化及合成基因方面的知识产权。

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