基因合成FAQ

Q1:与传统PCR克隆相比,基因合成有什么优点?

A1:基因合成有如下优点:

Q2:金斯瑞基因合成服务的优势有哪些?

A2:金斯瑞基因合成服务主要竞争优势:

Q3:金斯瑞能合成多长的基因?

A3:没有长度限制,金斯瑞可为您合成长达10 kb及以上的基因序列。且金斯瑞已挑战合成成功的基因有:长达50 kb的基因;>70%高GC含量或<30%低GC含量的基因;重复片段基因;强二聚体结构的基因;含100多个连续腺嘌呤的基因 (aaaaaaa……)等几千种复杂基因。

Q4:密码子优化有必要吗?

A4:对于用于蛋白表达的基因来说,多数情况下是有必要的。如真核生物的基因需要在原核生物中表达。由于真核生物的密码子偏好和原核生物有很大不同,对基因进行密码子优化将显著提高表达效率。

Q5:如需基因优化,我需要提供哪些信息?

A5:若需基因优化,我们需要您提供如下信息:a.被优化的基因序列或者蛋白序列;b.优化的宿主;c.基因两端需添加的酶切位点或者基因内部需去除的酶切位点;d.是否需要特定的终止密码子;e.是否需添加Kozak序列,对于哺乳动物系统我们一般建议您添加Kozak序列。

Q6:如想在两种不同的宿主中表达目的蛋白,金斯瑞是否能够在两种宿主中进行优化?

A6:可以。我们的优化工具可以帮助您同时针对两个不同宿主物种进行基因优化。该工具可同时载入两个宿主的密码子偏向性和顺势作用元件等优化参数,双宿主优化算法会搜寻两个宿主表达的平衡点,以求在两个宿主中都可以得到令人满意的蛋白表达量。但是在两个宿主物种的亲缘关系比较远等情况下,双宿主基因优化则很有可能在两个宿主中都得不到理想的优化结果。如果您在您的双宿主优化结果中发现了CAI小于0.80,大量顺势作用元件没有被过滤掉,或其他可能影响基因表达的现象,我们推荐您针对两个宿主分别使用我们的单一宿主优化方法。

Q7:在大肠杆菌表达系统中,哪种终止密码子具有偏好性?在哺乳动物系统中呢?

A7:在大肠杆菌中,TAG很少用;经常使用的是TAA;TGA也可以。在哺乳动物中,TGA的使用频率高于TAA和TAG。相对于哺乳动物和大肠杆菌之间的不同,密码子使用表在哺乳动物不同有机体间的区别不是很大。

Q8:pUC57-simple和pUC57这两载体有什么区别?在什么情况下,金斯瑞建议使用pUC57-simple载体?

A8:a.pUC57-simple载体在pUC57载体基础上去除了MCS区,仅保留了NdeI和EcoRV两个常用酶切位点;b.金斯瑞免费提供pUC57标准载体。通常来说,合成的基因将被克隆进标准载体的Sma I或EcoR V位点。如果客户要求避免一些载体上常用的酶切位点以方便后续的亚克隆需求,我们建议客户使用pUC57-simple载体。

Q9:金斯瑞可以将合成的基因克隆至我指定的载体吗?

A9:可以。除pUC57和pUC57-simple,其它的载体需要由客户自己提供。如果您需要将合成的基因克隆到您指定的载体上,需要您提供载体相关信息,我们会根据目的基因的长度收取相应的亚克隆费用。

Q10:基因合成服务提供的数据报告包含哪些文件,每个文件需要使用什么软件打开?

A10:您所收到的基因合成服务数据报告是RAR格式的压缩文件,可以使用Winrar(4.0以上版本)打开,数据报告共含有4 类文件,分别为:

Q11:如何使用金斯瑞基因合成交付的质粒及穿刺菌?

A11:质粒使用方法:

穿刺菌使用方法:

Q12:密码子优化过的基因,金斯瑞是否还提供蛋白表达服务?

A12:金斯瑞同时可为合成的基因提供蛋白表达及纯化服务。金斯瑞提供四大蛋白表达系统:原核蛋白表达系统、酵母蛋白表达系统、杆状病毒-昆虫细胞蛋白表达系统及哺乳动物细胞蛋白表达系统。